电气工程及其自动化专业2003年经教育部批准设立，2004年招生，2015年获批省级特色专业，2019年获批安徽省本科一流建设专业建设点，2022年控制科学与工程获批校级重点建设学科，2023年获批新型光电系统设备与驱动优化安徽省联合共建学科重点实验室（培育），2025年能源动力获批校级专业硕士学位培育点，电力信息技术获批校级重点建设学科。电气工程及其自动化融合电气工程、控制科学与工程、计算机科学等多学科知识的综合性学科，形成“强电与弱电结合、硬件与软件并重、电气与控制交叉”的复合型人才培养体系。
现有教师15人，企业兼职教师3人，其中博士（含在读）占比60%，硕士生导师3人，获省部级以上科技进步奖6项，教学成果奖一等奖1项，二等奖3项，省级教坛新秀1人。主持国家及安徽省自然科学基金等省部级科学研究项目10余项，发表高水平教科研论文140余篇，获批国家专利60余项，其中发明专利29项。
专业主要开设数学物理基础（高等数学、线性代数、概率论与数理统计、复变函数、大学物理和实验等）、电子电路基础（电路、模拟电路、数字电路等）、工程基础（电力工程基础、信号与系统、单片机原理及应用等）和专业课（电力系统分析、自动控制原理、电力电子技术、电气控制与PLC技术等）等课程，建有智能电网虚拟仿真实验室、电机拖动、电力电子技术等专业实验室，学生获省级以上学科竞赛奖项百余项（国家级32项，其中中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛铜奖1项），相关成果获批省级教学成果奖一等奖1项，二等奖3项。
电气工程及其自动化毕业生在国家电网、龙源电力、南方电网、阳光电源等电气相关龙头企业从事电气工程专业相关工作，毕业生去向落实率达96%；年均升硕率近20%，相继进入合肥工业大学、中国矿大、安徽大学等211高校深造学习。